שבועיים לאחר החלתה וכבר החלו שינויים ברפורמת התחבורה הציבורית בגוש דן. שר התחבורה ישראל כץ אישר ביצוע מספר שינויים בקווי הנסיעה החדשים, כ"השלמה לתוכנית הרה-ארגון", כך לדבריו. זאת, בהתאם להתחייבותו טרם החלת הרפורמה להתאימה במידת הצורך לדרישות הציבור. השינויים יכנסו לתוקף ב-5 באוגוסט.
מאז כניסתה של הרפורמה לתוקף נרשמו לא מעט תלונות כנגדה מצד ציבור משתמשי התחבורה הציבורית. לדברי כץ, נציגי משרדו קיבלו את כל ההערות ובכלל זה כאלה שהגיעו מגופים גדולים כמו רשויות מקומיות בגוש דן, בתי חולים ומפעילי התחבורה הציבורית, ובעקבותיהן הוחלט על סדרת השלמות ושינויים שיבוצעו בהמשך ועל בסיסי הרפורמה.
"הרפורמה בגוש דן יצאה לדרך, וכבר עתה ניתן להיווכח כי חלק גדול מהנוסעים החלו להטמיע הרגלי נסיעה חדשים שבשיטה החדשה, ומקצרים את זמן נסיעתם באמצעות מעברים מהירים, כנהוג במערכות אוטובוסים מתקדמות בעולם המערבי", כל לדברי השר כץ. "הרפורמה עובדת. אני משוכנע כי בתוך תקופת הסתגלות קצרה נוסעים חדשים רבים יעדיפו את התחבורה הציבורית על פני הרכב הפרטי".
ממשרד התחבורה נמסר כי ימשיכו לעקוב אחר ביצוע הרפורמה בקווי האוטובוסים בגוש דן ויהיו קשובים לפניות התושבים והגופים הרלוונטיים. על פי התכנית, במידת הצורך, יבוצעו התאמות נוספות בתום שלושה חודשים לרפורמה, משמע לקראת חודש אוקטובר.
השינויים שאושרו על ידי שר התחבורה וייכנסו לתוקפם ב-5 באוגוסט
קו 22 (משכונת המשתלה בתל אביב) - יבוטל לבקשת תושבי השכונה
קו 26 ו-126 מסלול הנסיעה ישתנה ויחבר בין בת ים ובית ספר הולץ והמסגר
קו 31 מתן קשר בין דרום רמת גן לתל-אביב
קו 40 (מהמרינה בבת ים לרמת החייל בתל אביב למסוף עתידים) יועתק למסוף האוניברסיטה במטרה לצמצם את עומס האוטובוסים במסוף ולהציע שירות נוסף עבור הסטודנטים
קו 72 ו-172 (מחולון לרידינג) מסלול הקו יעבור ברחוב דיזנגוף בתל אביב
קו 134 קו חדש מבני ברק לבית חולים תל השומר
קו 289 לבקשת תושבי חולון, מסלול הקו יצור קשר ישיר בין חולון וצפון תל אביב לבית חולים איכילוב
קשר ישיר בין בת ים ותחנה מרכזית בתל אביב ובין רח' יפת ביפו למרכז רפואי בת ימון
הוספת שירות לרחוב יוספטל בבת ים
חיבור בין שכונת עמידר לשדרות ירושלים בבת ים
קשר ממרכז העיר חולון למרכז רפואי בת ימון ושכונת ג'סי כהן
שיפור החיבור בין יפו ג' וד' לשדרות ירושלים ורח' המחרוזת
כמו כן יבוצעו שינויים נוספים בקווים מקומיים אחדים לבקשת הרשויות המקומיות