הנתיבים המהירים שבונים משרד התחבורה ונתיבי איילון לצד כביש 2 וכביש 20, ונועדו לשמש תחבורה ציבורית ושאטלים מחניוני הענק שנבנים בשפיים ובראשון לציון יהיו פתוחים לכאורה גם לרכב פרטי. "לכאורה", בגלל שהנסיעה לנהגים בנתיבים תהיה יקרה ומוגבלת, ותיאסר לגמרי על רוכבי אופנועים וקטנועים.
תקנות הפעלת הנתיבים מגלות כי הם יחולקו לשבעה אזורי חיוב, כאשר מחיר הנסיעה ינוע בין 6.99 שקל ל-104.91 שקל, ויעלו בהתאם לעומס בכביש, כמו בנתיב המהיר הקיים בכביש 1. אולם בניגוד לנתיב המהיר הקיים נהג עלול להיות מחויב בתשלום יותר מפעם אחת, עד לסכום מרבי של 300 שקל למי שיבקש לחצות חלק משמעותי מהפקק בגוש דן באמצעות נסיעה בנתיב בתשלום.
שבעת אזורי החיוב יהיו:
בין מחלף נתניה למחלף המעפילים בכביש 2, בין מחליף המעפילים למחלף ההלכה בכביש 20, בין מחלף ההלכה למחלף וולפסון בכביש 20, כל אלה לכיוון בדרום.
בין מחלף מבוא איילון לקטע שבין מחלף גיבורים למחלף השלום בכביש 20, בין הקטע של מחלף גיבורים-השלום ועד הקטע שבין רוקח למחלף הרצליה, בקטע הבא שעד מחלף געש בכביש 2, ובקטע שבין געש למחלף נתניה, בכביש 20 גם כן, כולם לכיוון צפון.
פטורים מתשלום יהיו השאטלים ואוטובוסים, ורכבים פרטיים שבהם לפחות נהג ושני נוסעים, כלומר שלושה בני אדם. תשלום הנסיעה יתבצע באמצעות אפליקציה, לפני הנסיעה או אחריה, בהתאם לדיווח עצמי.
נסיעה בניגוד לחוק תחויב בנוסף לדמי האגרה ב-84 שקל וב-28 שקל בפעם הראשונה. אי תשלום החוב במועד יחויב ב-42 שקל. מי שיעשה מעשה למניעת חיוב או זיהוי יחויב בקנס של 1,400 שקל. כניסה ויציאה מהנתיב במקום שלא נקבע לכך יעלו 280 שקל, בניסיון להילחם בנהגים שינסו לקצר את דרכם בלי לשלם. מצלמות יבצעו אכיפה נגד מי שלא נרשם, לצד וידוא שמי שהצהיר כי ברכבו יהיו לפחות 3 בני אדם כדי לנסוע ללא תשלום אכן עמד בהצהרה.
בנוסף יהיו זמנים בהם יאסר על רכב פרטי להיכנס לנתיב המהיר, כאשר יווצר עומס בכביש, כדי להבטיח לשאטלים ולתחבורה הציבורית נסיעה במהירות ממוצעת של 70 קמ"ש. זאת בהיותם של הנתיבים פרויקטים שנועדו לקדם תחבורה ציבורית, כאשר האפשרות להשתמש בהם כנתיב אגרה היא משנית.
למרות שמדובר בפרויקט שאמור לתמוך באלטרנטיבות לנהיגה ברכב פרטי, הוחלט לאסור לגמרי נסיעה בנתיבים בכביש 2 ו-20 ברכב דו גלגלי, ללא שינוי לגבי הנסיעה בתשלום בכביש 1. האיסור מנומק בכך שהנתיבים החדשים יהיו צרים יותר מהנתיב בכביש 1, וחשש לסיכון הרוכבים בנסיעה בנתיב מרובה אוטובוסים. זאת למרות שניסוי שנערך בתל אביב הראה כי סכנה, ובכבישים כמו נתיבי איילון וכביש החוף דווקא הנתיבים הרגילים עמוסים ומסוכנים יותר לרכב דו גלגלי. מחקרים שנערכו עבור משרד התחבורה הוכיחו שמעבר של נהגים לקטנועים ואופנועים מפחית את עומסי התנועה ומצוקת החנייה, בנתיבי איילון בחרו להתעלם מכך.
ויש גם הקלה למשתמשי הנתיב המהיר בכביש 1: עד עכשיו כדי לקבל שם פטור מתשלום הייתה חובה להיות 4 בני אדם ברכב בשעות העומס, ו-3 בשעות השפל. עם אישור התקנות תהיה הנסיעה חינם תמיד כבר מ-3 בני אדם בכל השעות.